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技術服務描述
Clip(crosslinking-immunprecipitation)染色質免疫沉淀
Clip(crosslinking-immunprecipitation)染色質免疫沉淀，是一項體內研究RNA分子與RNA結合蛋白相互作用的革命性技術。其主要原理是基于RNA與其相應的RNA結合蛋白會在紫外照射下會發(fā)生共價結合，以RNA結合蛋白的特異性抗體將RNA-蛋白復合物沉淀之后，回收其中的RNA片段，進行qRT-PCR檢測或測序分析。最近，這項技術也被應用于microRNA的靶標鑒定。
服務優(yōu)勢
1經紫外照射，細胞內的RNA與相應的RNA結合蛋白交聯(lián)，增強RNA與蛋白的結合能力
2可檢測多種RNA，如LncRNA、mRNA、microRNA。
3可通過mRNA的差異表達，檢測microRNA的靶標mRNA。
4 PAR-Clip可精確定位RNA與蛋白的結合位點。
服務內容
研究RNA與RNA結合蛋白的相互作用
研究microRNA的靶標mRNA
服務流程
1狀態(tài)良好的細胞在356nm的紫外燈下照射一定時間
2收集細胞，制成蛋白提取液
3磁珠與抗體孵育
4帶有抗體的磁珠與蛋白提取液孵育
5清洗磁珠，加Trizol提取RNA，進行qRT-PCR或測序分析
Clip與RIP的區(qū)別
Clip與RIP的共同點：都是用于研究RNA與RNA結合蛋白互作的實驗方法
Clip的優(yōu)勢：Clip與RIP的實驗方法基本一致，Clip在細胞裂解前要經過紫外的照射?；罴毎涀贤庹丈浜螅?/span>RNA與RNA結合蛋白會發(fā)生共價結合，結合能力強。而RIP細胞中的RNA與RNA結合蛋白通過氫鍵和范德華力結合，結合能力較弱。因此，RIP實驗的洗脫過程中，會損失大量的RNA，而Clip實驗有效的避免了這一點。
客戶提供
IP級別的蛋白抗體
所研究的細胞株
我們提供
qPCR原始數據及處理結果，測序分析原始數據及處理結果