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染色質(zhì)免疫沉淀技術 ChIP

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ChIP實驗服務

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實驗技術流程

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實驗常見問題

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結(jié)果分析

對于一幅ChIP-qPCR實驗結(jié)果Figure，應包含位點作用示意圖、qPCR結(jié)果數(shù)據(jù)分析圖，并應在Supplement中補充相關的驗證性實驗圖片，具體如下圖所示。

ChIP model figure

     Figure A：

      未處理組（Mock）與處理組（Treat）RNA聚合酶II分別與目的基因啟動子調(diào)控區(qū)域A區(qū)域、D區(qū)域、G區(qū)域的結(jié)合。處理后RNA聚合酶II與A區(qū)域、G區(qū)域結(jié)合明顯增加，D區(qū)域結(jié)合情況未有明顯變化。

ChIP model figure A


      Figure B：

      未處理組（Mock）與處理組（Treat）轉(zhuǎn)錄因子1（TF1）分別與目的基因啟動子調(diào)控區(qū)域A區(qū)域、B區(qū)域、C區(qū)域、D區(qū)域、E區(qū)域、F區(qū)域、G區(qū)域、H區(qū)域、I區(qū)域的結(jié)合情況比較。未處理組（Mock）：轉(zhuǎn)錄因子1（TF1）與目的基因啟動子調(diào)控區(qū)域A、B、G、H有結(jié)合，但與D、E、I區(qū)域有不明顯的少量結(jié)合，且與C、F組不結(jié)合。處理組（Treat）：轉(zhuǎn)錄因子1(TF1)與目的基因啟動子調(diào)控區(qū)域A、B、C、D、E、F、G、H、I均有結(jié)合，且與A、B、G、H區(qū)域的結(jié)合經(jīng)處理后明顯的大量提升，且原本不結(jié)合的C、F區(qū)域處理后有少量結(jié)合，對D、E、I區(qū)域的結(jié)合情況無明顯改變。

ChIP model figure B


      Figure C：

      未處理組（Mock）與處理組（Treat）轉(zhuǎn)錄因子2（TF2）分別與目的基因啟動子調(diào)控區(qū)域A區(qū)域、B區(qū)域、C區(qū)域、D區(qū)域、E區(qū)域、F區(qū)域、G區(qū)域、H區(qū)域、I區(qū)域的結(jié)合情況。未處理組（Mock）：轉(zhuǎn)錄因子2（TF2）與目的基因啟動子調(diào)控區(qū)域G、H有明顯結(jié)合，與A、B、C、I區(qū)域有少量的結(jié)合，且與D、F組不結(jié)合。處理組（Treat）：轉(zhuǎn)錄因子2(TF2)與目的基因啟動子調(diào)控區(qū)域A、B、C、D、E、F、G、H、I均有結(jié)合，且與A、B、G、H區(qū)域的結(jié)合經(jīng)處理后明顯的大量提升，且與C、I區(qū)域的結(jié)合經(jīng)處理后也有提升，與且原本不結(jié)合的D、F區(qū)域處理后有少量結(jié)合，對E區(qū)域的結(jié)合情況無改變。

ChIP model figure C


      Figure D：

      未處理組（Mock）與處理組（Treat）轉(zhuǎn)錄因子2（TF2）分別與目的基因啟動子調(diào)控區(qū)域Chr1.3q4（1號染色體3q4座位）的區(qū)域：A區(qū)域、B區(qū)域、C區(qū)域、D區(qū)域、E區(qū)域、F區(qū)域、G區(qū)域、H區(qū)域、I區(qū)域的結(jié)合情況。未處理組（Mock）：H3K7Ac（3號組蛋白7號賴氨酸位點乙酰化修飾蛋白）與目的基因啟動子調(diào)控區(qū)域A,B C G、H有明顯結(jié)合，與D、E、F、I區(qū)域有少量的結(jié)合。處理組（Treat）：H3K7Ac（3號組蛋白7號賴氨酸位點乙?；揎椀鞍祝┡c目的基因啟動子調(diào)控區(qū)域A、B、C、D、E、F、G、H、I均有結(jié)合，且與A、B、C、G、H、I區(qū)域的結(jié)合經(jīng)處理后明顯的大量提升，且與D、E區(qū)域的結(jié)合經(jīng)處理后也有少量提升。

ChIP model figure D

      

      Supplement：

      A 預實驗：WB檢測轉(zhuǎn)錄因子在細胞核內(nèi)表達

ChIP model figure S.A


      B 細胞核抽提物被經(jīng)過超聲波打斷或核酸酶酶解后DNA電泳，表示基因組DNA被打斷成500bp左右的片段，方便后續(xù)的免疫共沉淀實驗。

ChIP model figure S.B


      C ChIP-qPCR實驗后，體系內(nèi)的DNA片段擴增物進行DNA電泳，檢測qPCR擴增產(chǎn)物是否和設計相符，以及檢測是否有引物二聚體產(chǎn)生影響實驗。

ChIP model figure S.C

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