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Long Noncoding RNA High Expression in Hepatocellular Carcinoma Facilitates Tumor Growth Through Enhancer of Zeste Homolog 2 in Humans
日期:2016-04-19 標簽:lncRNA-HEIH,EZH2
lncRNA HEIH與蛋白EZH2互作
文章研究思路

核心Figure

Figure說明:Figure主要闡述的是lncRNA HEIH與蛋白EZH2的相互作用。A:RIP實驗。利用EZH2抗體,在Huh-7細胞和HCCLM3細胞中,釣取與蛋白EZH2結合的lncRNA,qPCR檢測,結果證實蛋白EZH2與lncRNA HEIH有相互作用(Ab-1和Ab-2為lncRNA HEIA的兩個檢測位點)。B:將A圖結果數(shù)據(jù)化。 C:利用RIP實驗驗證蛋白actin和AK055007與lncRNA HEIA無相互作用,作為A圖對照。D:作為A圖的反向驗證,用RNA pull down驗證lncRNA HEIH與蛋白EZH2有相互作用。E:利用RNA pull down進一步驗證蛋白EZH2與 lncRNA HEIH結合區(qū)域。
我們公司可以提供的技術服務
一、RIP

RIP(RNA 免疫共沉淀)技術,主要--研究蛋白與RNA的相互作用,主要原理是利用特定的蛋白抗體,在全蛋白提取液中捕獲特定蛋白,特定蛋白含有與之結合的RNA,洗脫RNA,反轉錄,qPCR檢測。我公司在實驗體系中設置陽性及陰性對照,進一步排除系統(tǒng)誤差。
二、RNA pull down

RNA pull down技術,主要研究lncRNA與蛋白的相互作用,主要原理是體外轉錄生物素標記的RNA,標記有生物素的RNA吸附到鏈霉親和磁珠上,RNA與全蛋白提取液孵育,捕獲互作的蛋白,后續(xù)進行銀染-質(zhì)譜或Western檢測。我公司在實驗體系中同時提供lncRNA正義鏈與反義鏈的pull down。
三、預測lncRNA與蛋白互作位點

通過相關的預測軟件預測lncRNA的結合位點,根據(jù)結合位點設計實驗方案,利用RNA pull down實驗,進一步驗證蛋白與lncRNA的結合區(qū)域。
原文鏈接:Long Noncoding RNA High Expression in Hepatocellular Carcinoma Facilitates Tumor Growth Through Enhancer of Zeste Homolog 2 in Humans (提取碼:21b3)
來源:360云盤
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